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2020.8.26丨Nanopore甲基化测序产品概述

一、Nanopore甲基化 基本概念 甲基化属于表观遗传遗传学: 基于基因序列改变所致基因表达水平变化,如基因突变、基因杂合丢失和微卫星(SSR) 等表观遗传学: 指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲…

Tombo安装和使用教程

0. 引言 Tombo是nanopore开发的从三代测序数据中检测DNA modification (DNAmod: Home) 的工具。其他工具还有nanoraw,nanomod,deepmod,signalalign等。由于tombo的安装对依赖包版本的要求比较严格,所以写下本人终于成功的辛酸泪水,供大家避坑。 参考文献:DNA methylatio…

Oxford Nanopore Technologies实战应用之电信号比对工具Tombo

目录 一、前言 二、Tombo快速使用 1.安装 2.快速使用 3.比对结果解析 4.高阶应用 三、总结 一、前言 对于纳米孔测序常规用途,如基因组比对、SNV鉴别、宏基因组物种分析而言,用户一般使用碱基识别软件输出的fastq文件即可展开相应分析。但对于某些特…

2024.09.04【读书笔记】|如何使用Tombo进行Nanopore Direct RNA-seq(DRS)分析

文章目录 Tombo快速使用介绍模型介绍RNA修饰分析步骤特异性替代碱基检测(推荐)De novo canonical model comparison ONT全长转录组分析步骤疑难解答Minimap2在比对nanopore直接RNA-seq数据时的最佳实践和参数设置有哪些?featureCounts在进行R…

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oAuth2

oAuth2 什么是oAuth2什么是 SpringSecurity为什么需要oAuth2名词解释交互过程令牌的访问与刷新AccessTokenRefreshToken 客户端授权模式简化模式授权码模式密码模式客户端模式 什么是oAuth2 说白了oAuth2.0的核心就是解决资源拥有者与资源服务器之间的互信问题而提出的一个安全…

第六章 字符串操作

6.1 处理字符串 6.1.1 字符串字面量 在此次,我们主要解决一个问题,就是怎么在字符串中再插入单引号。都知道字符串本身是自带引号的,所以再单引号中再次插入单引号就无法执行,就要采用一些办法。 1. 双引号 对于字符串来说&am…

Blocked aria-hidden on a <div> element because the element that just received focus must not be

最近浏览器上突然出现了一个报错。 调研了一下发现是浏览器版本的原因​ 解决方法 在全局样式里面添加一下样式 .ant-modal div[aria-hidden"true"] {display: none !important}

在Java世界中升级:面向对象的编程冒险

引言:角色创建 在一个充满代码与逻辑的世界里,生活着一位年轻的编程勇士——Java勇士。为了成为一名出色的程序员,他决定踏上探索Java面向对象编程的冒险之旅。这条路上有许多未知的挑战等待着他,但他知道,只要坚持不懈…

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solr教程,值得刚接触搜索开发人员一看

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人类的文明史高达几千年,但大多数时间里的大多数国家或者民族都是默默无闻的,纵观世界各国,真正能在历史上建立顶级强国的国家到今天两只手都数的过来。 下面说一下顶级强国的标准: 所谓的顶级强国就是,在历史上能达…

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第2章 传输网

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