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跟着官方文档学DGL框架第一天——DGL概览

主要参考:https://docs.dgl.ai/tutorials/basics/1_first.html DGL是什么 DGL是一种用于简化图神经网络实现的包,感觉官方文档写得很亲民,打算好好拜读一下。 教程问题描述 文档先给出一个“Zachary空手道俱乐部问题”的小例子&#xff0…

四个数据欧几里得距离_常见的群落相似性或距离测度的计算

常见群落相似性或距离测度的计算 前篇已经初步讲述了关于群落多样性分析中的Beta多样性基本概念,并提到常见的Beta多样性分析方法一般建立在群落相似性/或距离测度的基础上,以及初步介绍了有关群落相似性/或距离测度的基础。 相似性或距离的衡量标准有很多种,Legendre和Lege…

口腔微生物输入量的差异决定了与健康状况相关的两种微生物群肺炎类型

口腔微生物输入量的差异决定了与健康状况相关的两种微生物群肺炎类型 〉原文:Differential Oral Microbial Input Determines Two Microbiota Pneumo-Types Associated with Health Status 〉网址:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.20…

四个数据欧几里得距离_常见的相似性/距离指数

转自CSDN用户刘永鑫Adam的文章221.Beta多样性PCoA和NMDS排序 Jaccard: Jaccard相似性指数(Jaccard similarity index)将两个样方共享的物种数量(a)除以两个样方中出现的所有物种的总和(a + b + c,其中b和c是仅在第一个和第二个样方中出现的物种数量)。计算公式如下: 其…

Microbiome:揩老鼠皮毛揩来高分文章——野生哺乳动物的皮肤和肠道微生物群对环境污染做出的反应

文章目录 野生哺乳动物的皮肤和肠道微生物群对环境污染做出的反应划重点热心肠日报摘要背景结果结论关键词 前言方法堤岸田鼠诱捕与研究设计放射量测定拭子样本采集DNA提取和16S rRNA基因测序数据处理统计分析 结果堤岸田鼠皮肤微生物组成SK菌群组成的alpha和beta多样性基于SK菌…

机器学习领域几种距离度量方法metric详解

对scipy.spatial.distance.pdist(X, metriceuclidean, *args, **kwargs)中metric的介绍. 【常用的已标红】 1.braycurtis Bray-Curtis 相异度(Bray-Curtis dissimilarity)是生态学中用来衡量不同样地物种组成差异的测度。其计算基于样本中不同物种组成的…

线性关系r范围_一个简单线性回归和多项式回归在R中的实现示例

一个简单线性回归和多项式回归在R中的实现示例 常见线性回归的原理就不多说了,大家都懂,就是普通最小二乘法( Ordinary Least Square , OLS )回归法,主要用于简单线性回归、多项式回归和多元线性回归。 R语言中,拟合线…

R统计-微生物群落结构差异分析及结果解读

前一段时间忙着转录组数据分析,说好的群落结构差异分析结果解读,严重拖更。期间微生信生物公众号发布了微生物群落分析的详细流程。感觉写的详细,跟我这种已经转了1年半行的确实不一样。虽然......,但是我还是想把硕士期间的笔记整理出来&…

XML 之父 Tim Bray:谷歌为什么要搞 Android?

点击上方“芋道源码”,选择“设为星标” 做积极的人,而不是积极废人! 源码精品专栏 原创 | Java 2019 超神之路,很肝~中文详细注释的开源项目RPC 框架 Dubbo 源码解析网络应用框架 Netty 源码解析消息中间件 RocketMQ 源码解析数…

微生物多样性数据的可视化技巧

在数据中穿梭找寻答案,是我们在探索微生物世界的过程中必不可少的一环。然而,单调的数据分析报告是否让你感觉枯燥乏味?这时候数据可视化的技术可就要来大展神通咯!利用图表和图形唤醒沉睡的数据,科学与艺术的搭配&…

Bray0-1.pcapng(Tomcat)

1、分析Bray0-1.pcapng数据包文件,通过分析数据包Bray0-1.pcapng找出恶意用户目录扫描的第2个目录名,并将该目录名作为Flag提交: 过滤http包 2、分析Bray0-1.pcapng数据包文件,分析出恶意用户通过哪个目录写入的一句话木马,并将该目录名作为Flag提交:

XML之父Tim Bray :APP正变得越来越糟,包括用机器学习来了解用户需求

作者:Tim Bray(前亚马逊副总裁兼云服务负责人,XML 的奠基人之一)译者:刘媛媛 很多时候,一个非常流行的应用软件在更新后会出乎意料地变得很糟:变得更加复杂难以使用,或是删除了某些重…

如何在 R 中计算 Bray-Curtis 相异度

Bray-Curtis Dissimilarity是一种衡量两个不同站点之间差异的方法。 它经常在生态学和生物学中用于量化两个地点在这些地点发现的物种的不同之处。 计算如下: BC ij = 1 – (2*C ij ) / (S i + S j ) 在哪里: C ij:在每个站点中发现的物种的较小值的总和。 S i :在站点…

Bray-Curtis距离

Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的,主要基于OTUs的计数统计,比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离,包含的信息完全不一样;相比于jaccard距离,Bray-Curtis则包含…

Bray-curtis,unifrac,weighted unifrac,jaccard计算方法比较

原文链接:https://www.jianshu.com/p/066d90b556ad 1、微生物β多样性 利用宏基因组、16s rRNA测序等高通量测序技术分析微生物群体结构的时候,常见到有α和β多样性两个指标。α多样性主要反映样本内多样性,而β多样性指的是样本间多样性&…

oppoReno4se和oppoa72哪个好

oppoReno4SE将选用一块6.43英寸的AMOLED屏幕,分辨率为1080x2400,屏占比超过90%,重量为186g,拥有超闪蓝、超闪黑、超闪白三种手机配色; oppoReno4se更多使用感受和评价:https://www.oppo.com/4se oppoa72更多…

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