欢迎浏览我的CSND博客！ Blockbuater_drug …点击进入 文章目录 前言一、蛋白结构预测模型评价指标TM-scorelDDT 二、Alphafold中的评价指标pLDDTpTMPAE 三、AlphaFold-multimer 蛋白结构的评价指标DockQipTM 总结参考资料 前言 本文汇总了AlphaFold和AlphaFold-mul…

PyPDB：Python 3 下的蛋白质数据库搜索工具 项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pypdb 项目介绍 PyPDB 是一个基于 Python 3 的工具包，专门用于在 RCSB 蛋白质数据库（PDB）中执行高级搜索。通过 PyPDB，用户可…

背景简介 蛋白质数据集来自于结构生物信息学研究协作组织（RCSB）的蛋白质数据库（PDB）。 RCSB : Research Collaboratory for Structural Bioinformatics PDB : Protein Data Bank PDB是原子坐标和描述蛋白质和其他重要生物大…

文章目录 前言一、环境准备二、爬取PDB蛋白结构1.下载指定数量的随机PDB2.下载指定靶标的PDB二、从ZINC爬取小分子mol2结构1.下载指定数量的随机分子2.下载指定分子三、从ChEMBL爬取小分子信息1.下载指定ID的SMILES（测试不成功，网站变成readonly了）四、从uniprot爬取fasta序…

欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132416164 免责声明：本文来源于个人知识与开源资料，仅用于学术交流，不包含任何商业技术，欢迎相互学习，不支持转载。 Protein Data Bank (PDB) 是一个收集和存储三…

pdb文件字段说明学习： 1、pymol安装使用 参考：https://blog.csdn.net/eternalapple/article/details/110263296 官网：https://pymol.org/ 安装： 1、可以直接conda安装，一条命令 conda install -c schrodinger pymol-bundle安装成功后输入pymol即可调出窗口2、 也可以…

请参考rcsb官方提供文档接口 由于python提供接口简单,所以选择了它 程序流程 1.从thefile.txt 文件中读取蛋白序列 2.然后从rcsb 查询,获取查询XML数据 3.解析XML文件 4.下载pdb文件python代码 可以用python name.py 直接运行. #!/usr/bin/python # -*- coding: UTF-8 -*-…

环境： 1.攻击者IP：192.168.1.10 系统: KALI2022（vmware 16.0） 2.靶机IP：192.168.1.8 系统：Windows 7 6.1.7601 Service Pack 1 Build 7601 已开启远程协助RDP服务开启了3389端口 问题描述： KALI 如何利用CVE-2019-0708漏洞渗透Win7 解决方案： 1.打开kali，msf搜索…

用过MySQL之后，不论容量的话，发现比其他两个(sql server 、oracle)好用的多，一下子就喜欢上了。下面给那些还不知道怎么弄的童鞋们写下具体的方法步骤。 我这个写得有点太详细了，甚至有些繁琐，有很多步骤在其他的教程文…

附件下载 联系工作人员获取附件 实现 下面是使用混合模式设计多边形扫描仪的示例。 本文使用以下功能： 创建多边形物体 混合模式 多重结构 多边形扫描仪是使用多面镜的光学系统。 用一面镜子反射的光学系统可以按序列模式进行。 但是，如果多面镜像旋转，并且您希望在下一…

附件下载 联系工作人员获取附件 这篇文章介绍了什么是双折射现象、如何在OpticStudio中模拟双折射 (birefringence)、如何模拟双晶体的双折射偏振器以及如何计算偏振器的消光比。 什么是双折射现象 一般的光学材料都是均匀的各向同性的，也就是说无论光从哪个方向穿过材料，…

内容来自b站：浅唱的时光，北理工 序列模式：每个表面只追击一次

附件下载 联系工作人员获取附件 本文介绍了眼科镜片的设计原理，并讨论了镜片、眼睛和视觉环境中对镜片设计十分关键的参数，其中包括了常见镜片材料（涵盖了玻璃和聚合物）的玻璃目录。本文不包括渐进式镜片设计，尽管渐进式镜片时常根据一般的镜片曲率原则进行设计，但这些基…

附件下载 联系工作人员获取附件 本文展示了利用几何图像分析特性来计算多模光纤耦合效率的方法。 还有使用IMAE操作数优化多模光纤耦合效率的方法。该方法只适用于包含大量模式的多模光纤。 简介 我们可以使用OpticStudio中的几何图像分析（Geometric Image Analysis）来计算…

所用软件的版本：matlabR2022a, Zemax opticStudio2024R1 交互扩展功能，Zemax和matlab可以同时打开，操作会比较方便（正在学习因此只能写一部分） 目录 1.zemax中，选择编程->MATLAB->交互扩展 2.mat…

前言 本文可以看做是本文《千亿参数开源大模型 BLOOM 背后的技术，这是其英文原文》与相关论文的解读，但修正了原文中的部分细节错误，以及补充了大量的解释说明，使得其读起来一目了然、通俗易懂 第一部分 BLOOM与其背后的Megatron…

修改了libBinder 但是编译不过 由于修改adiDiff 工具源码，编译的时候，编译不过，下载google 源码，网络原因下不下来，只能修改编译脚本，跳过vndk 检测。

报错内容：[ERROR] InnoDB: The Auto-extending innodb_system data file ‘/data/mysql-33061/data/ibdata1’ is of a different size 768 pages than specified in the .cnf file: initial 131072 pages, max 0 (relevant if non-zero) pages! 问题分析&#xff…

centos6.5安装完mysql，输入mysql，提示： 重启mysqld： **查看日志文件：*more /var/log/mysqld.log，显示InnoDB: auto-extending data file ./ibdata1 is of a different size 640 pages (rounded down to M…

【Trailhead题目解析】Business Administration Specialist Challenge 2 目录 问题 解决 问题 The solution for extending access is not assigned to the right user or is not granting access to the right field. 所有都按照要求去做了 Shinje Tashi Role: CEO Prof…