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古细菌多样性分析16S rRNA

古细菌(archaebacteria)又叫古生菌、古菌,是一类很特殊的细菌,同时具有原核生物和真核生物的某些特征。古细菌多生活在各种极端的生态环境中,它们代表了生命的极限,确定了生物圈的范围。古细菌和真细菌、真核生物一起,构成了生物的三域系统。古细菌分为泉古菌、广古菌、…

细菌或原核生物16S rRNA

细菌核糖体RNA(rRNA)有三种类型:5S rRNA(120bp)、16S rRNA(约1540bp)和23S rRNA(约2900bp)。5S rRNA基因序列较短,包含的遗传信息较少,不适于细菌种类的分析鉴定;23S rRNA基因的序列太长,且其碱基的突变率较高,不适于鉴定亲缘关系较远的细菌种类;16S rRNA普遍存…

微生物多样性数据分析(16S)

微生物多样性数据分析(16S) 9个可变区,10个保守区,扩增V3区、V4区、或者一起、或者V6、V9。 OTU(Operational taxonomic unit) OTU(operational taxonomic units) 是在系统发生学研究或群体遗传学研究中,为了便于进…

16s扩增子分析注意事项和经验总结Tips

个人1年多16s/ITS扩增子分析中积累的点点滴滴,此文适合新人了解相关零散知识,也适合有分析经验的人交流与讨论。 以下分析的经验,是以测序数据类型为Illumina HiSeq 2500产出的双端250数据类型(PE250)为基础。 扩增测序技术选择&#xff1a…

16S测序

这篇文章主要写介绍16S测序的相关知识,之后如果我有时间会写16S的数据处理,设计生物信息学的内容。 文章目录 宏基因组学扩增子测序全基因组测序 微生物微生物鉴定形态学生理学噬菌体血清型核酸碱基组成分子杂交 16S测序S-沉降系数超速离心16SrDNA和16Sr…

16s rDNA数据分析经验总结

原文来自fanyucai博文,有修改和删减。 去除嵌合体序列,推荐使用UCHIME多样性中,距离选择现在包括两种,一种是物种距离(Jaccard\Bray-Curtis);另一种是基于进化的距离(Unifrac),基于进化的距离还…

【QIIME2】细菌16s数据库_Greengenes2

文章目录 下载并选择合适的版本在QIIME2中使用classify-sklearn && classify-consensus-blast 区别? 下载并选择合适的版本 下载网址:https://ftp.microbio.me/greengenes_release/current/ 或 https://ftp.microbio.me/greengenes_release/202…

魅族16s/16s Pro 降级救砖教程(安卓10内测版降级教程)

降级说明 1.本教程的线刷方法为9008降级救砖方法,魅族16s 与 魅族16s Pro 的降级救砖、内测降级都可参考本文。 2.本教程只针对 魅族16s 降级到 Flyme 7.3.0.0A 和 魅族16s Pro 降级到 Flyme 7.3.4.0A 进行操作说明。 3.此降级方法将会清除所有数据,刷机…

微生物16S测序数据的正确打开方式

16S rRNA基因测序(也称16S rDNA测序)是最常用的菌群多样性分析的手段。对于新手,如果收到一份不讲“人话”的16S测序分析报告,很快就会被各种生态学术语、各种指数、各种分析方法弄晕。 7个问题串起16S测序的核心结果 怎么办&…

一文读懂微生物扩增子16s测序

微生物多样性测序结果如何看? 做过16s测序的小伙伴们都知道 测完之后会拿到一份结果报告 但这并不代表可以开始写文章了 看似一大堆数据图表却不知如何下手 这是很多人头疼的地方 那么怎样给报告中的数据赋予灵魂 让它真正成为对你有帮助的分析呢? 一文扫…

Nanopore牛津纳米孔测16S学习笔记

身处这样一个互联网时代,应当感恩技术带来的便利,从在一个地方不远游就只能是井底之蛙,到今天互联网让我们不出门知天下事,当然,假消息也有。虽然现在许多事和技能仍然需要项目实践,但是不得不说&#xff0…

Nanopore 16S测序数据分析流程之blast/last

最近有朋友和我交流纳米孔16S测序数据的分析,发现真的没有从头完成过一次这方面的数据分析,然后发现这方面的资料也比较少,于是学习一下,和大家分享。坦白说,牛津纳米孔测序技术在16S多样性研究方面还是有些不足的&…

haneWIN Software NFS工具的使用

在arm开发板挂载win10的文件夹时,使用NFS工具连接文件 配置win10挂载目录 配置之后,启动Start NFS Server 服务 重启ARM开发板 连接开发板之后,执行: mount -t nfs -o nolock 2.16.30.223:/mfs /mnt/nfs注意: 1、文件…

haneWIN NFS服务器端 V1.1.69 汉化版

看了gamepc的NFS服务器搭建,找到了haneWIN NFS英文版,英文用起来看着不爽,虽然设置很简单!于是将其汉化。主要界面汉化效果如下: 软件汉化主要自用,可能不会随版本进行更新,对本汉化版本有兴趣的…

Windows服务器搭建NFS服务Linux服务器连接--haneWIN NFS Server

haneWIN NFS Server部署配置 1、软件下载2.运行及配置3.Linux挂载使用3.1 挂载3.2 使用测试3.2.1 创建3.2.2 删除 3.3 取消挂载 4.其他配置4.1 haneWIN NFS Server配置白名单4.2 语言补充 1、软件下载 访问官网:https://www.hanewin.net/,选择“haneWIN…

群晖挂载windows系统共享的nfs文件夹--使用第三方工具hanewin

前因:DSM的手机APP很好用,可以用来在局域网内和外网直接播放存储在DSM硬盘上的视频和音乐。 困难:DSM中的硬盘是需要物理独占的,而且是独占整块盘,并且会把硬盘的格式转换为EXT4。那样这个硬盘取下直接在Windows中是无…

windows上搭建NFS服务器--haneWIN,Linux客户端挂载

在进行嵌入式开发时常常需要在板子上用nfs挂载宿电脑, 公司现在的架构是远程服务器加windows个人电脑,因此需要在个人电脑的windows系统上搭建NFS服务器。 一、windows上搭建NFS服务器 NFS服务器软件:haneWIN 1.1.69 汉化已注册的版本 互联网上有下载,我这里再放一个我上…

arm开发板挂载win10和ubuntu haneWIN NFS Server

arm开发板挂载win10 haneWIN NFS Server 1 win10上的HaneWIN NFS Server1.1 安装HaneWIN NFS Server1.2 HaneWIN启动1.3HaneWIN配置 2 client端挂载2.1 挂载出现 busy 3 Ubuntu作为NFS ServerReference 1 win10上的HaneWIN NFS Server 1.1 安装HaneWIN NFS Server 下载地址【…

Windows haneWin 配置 以及 在linux上挂载

haneWin 配置 [共享的路径] [-name:共享名字] [服务端地址(权限)] 例如:D:\public -name:nfs *(rw,no_root_squash)如果需要在linux上有修改的权限,需要打开如下设置: linux 挂载 nfs服务器 mount [-t nfs] [-o noloc…

windows7 上搭建NFS服务器--haneWIN

转自和修改自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_553761ef0100oevm.html windows上搭建NFS服务器--haneWIN,Linux客户端挂载 2018年11月15日 14:10:59 fire_drangon 阅读数 1614 版权声明:转载请注明出处。 https://blog.csdn.net/zhenglie1…