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Linux系统下RNA-seq分析（利用bowtie2比对）
目录
文章目录
一、比对
1.建立基因组索引
2.作图
3.SAM文件处理
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KeyarchOS安装Bowtie2
1 概述
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The bowtie2 aligner
本文翻译自
Bowtie2使用Bowtie 2索引和一组测序读取文件，输出一组格式为SAM的比对结果。
"比对"指的是我们检测读取序列与参考序列之间的相似性方法。一个"比对"就是这个过程的结果，换句话说：一个比对就是将一些或全部…
)
在KeyarchOS操作系统上安装运行Bowtie2(测序序列与参考序列比对)
目录
1 概述
2 安装准备
2.1 操作系统环境
2.2 Bowtie2版本
3 安装
3.1 安装Python
3.2 安装Bowtie2
3.3 配置Bowtie2
4 运行Bowtie2
4.1 构建参考基因组索引
4.2 单末端测序 1 概述
浪潮信息KOS是浪潮信息基于Linux Kernel、OpenAnolis等开源技术自主研发的一款服…
生信软件 | bowtie2（测序序列与参考序列比对）
文章目录 一、介绍二、安装1. Conda 安装2. 传统安装 三、使用1、参考基因组比对必需参数可选参数（常用） 2、构建索引官方索引自建索引 3、一个完整例子4. 其他命令5. 报错解决5.1 错误信息：bowtie2-align exited with value 1 一、介绍
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