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GEPIA:TCGA和GTEx表达谱数据分析平台

欢迎关注”生信修炼手册”! GEPIA整合了来自TCGA和GTEx项目中的基因表达谱数据,提供了多种数据分析和可视化功能,操作简单,方便广大科研人员对肿瘤的表达谱数据进行挖掘,对应的文章发表在Nucleic Acids Research,链接如下 https://academic.oup.com/nar/article/45/W1/W98…

生信分析矫正P值_TCGA数据分析系列(二):数据库之GEPIA2

所谓工欲善其事,必先利其器,从今天开始,我们来介绍TCGA数据库的使用。今天我们来介绍一款非常容易上手的数据库:GEPIA2 链接点这里 话不多说,直接进入正题 GEP1A2数据来源 如图所示,GEPIA2数据来源于TCGA和GTEx数据库。TCGA我们已经介绍过,不过GEPIA2对TCGA数据经过了筛…

北京大学张泽民院士开发的生信在线分析工具,已有两千多篇文章引用,出图美观,操作简单!...

TCGA中存放的不同类型癌症的各类组学公开数据为科研人员进行数据挖掘和深入了解基因功能提供了宝贵的机会。对于没有编程基础的小伙伴,现在有很多在线平台都非常好用, 今天给大家分享一个被高频引用的在线工具:GEPIA2 GEPIA被引文献数 数据库…

分享分析TCGA的数据库——GEPIA(二)

书接上回:​​​​​​分享分析TCGA的数据库——GEPIA(一)_李京弦的博客-CSDN博客GEPIA——国产TCGA可视化网站https://blog.csdn.net/weixin_46500027/article/details/123839795?spm1001.2014.3001.5501 继续将GEPIA的分析: 4…

生信工具 | TCGA数据分析工具GEPIA最新更新,用于免疫细胞浸润分析

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等,现在,这个数据库又更新了新功能,那就是免疫细…

分享分析TCGA的数据库——GEPIA(一)

上回提到TCGA的一个下载数据库UCSC Xena数据库: 分享一个TCGA数据库_李京弦的博客-CSDN博客 今天分享一个TCGA分析的数据库——GEPIA,网址是:GEPIA (Gene Expression Profiling Interactive Analysis) 下面我们以一个基因——A…

Mybatis-Plus开发提速器mybatis-plus-generator-ui

前言 在基于Mybatis的开发模式中,很多开发者还会选择Mybatis-Plus来辅助功能开发,以此提高开发的效率。虽然Mybatis也有代码生成的工具,但Mybatis-Plus由于在Mybatis基础上做了一些调整,因此,常规的生成工具生成的代码…

linux crontab oracle exp 12162,RedHat Linux下使用Crontab实现Oracle 10g 定时备份

RedHat Linux下使用Crontab实现Oracle 10g 定时备份(包含SFTP下载说明)。 这是说的定时备份是热备份,也就是写shell脚本,这是的语法是oracle10g的,9i稍微修改(用exp语法) 定时备份后,可以用客户端机器自动下载,用sftp客…

linux crontab oracle exp 12162,linux中执行定时任务对oracle备份(crontab命令)

执行定时任务对oracle表数据备份: 1、创建sh脚本 [oraclelocalhost ~]$ vi bak.sh 2、添加脚本内容 #!/bin/bash #:本脚本自动备份7天的数据库,每次备份完成后,删除7天之前的数据。 #加载oracle的相关参数 #如果oracle参数不明确,…

linux crontab oracle exp 12162,排故篇 | linux环境下的oracle用户定时命令crontab任务报错不可用的原因分析和解决...

oracle用户下编辑计划任务时(crontab -e),报错如下: [oraclecrm-ethanDB ~]$ crontab -l You (oracle) are not allowed to access to (crontab) because of pam configuration. 什么鬼? 明明前几天还使用过crontab命令,问了下运维…

ORA-12162错误解决

新来的一个小伙儿,想学习Oracle我给了他文档,自己研究着,下午时段叫我过去,发现其在装oracle后,进行测试时报ORA-12162错误,正好本鸟之前也遇到过,这里面贴出了大家如有遇到不要惊慌。 报错图片…

Linux下报ora-12162,登录RMAN 报ORA-12162:TNS:net service name is incorrectly specified错误

登录RMAN 报ORA-12162:TNS:net service name is incorrectly specified错误 [Oraclelocalhost admin]$ date Tue Apr 22 18:06:16 CST 2014 [oraclelocalhost admin]$ rman target / //出现诡异的ora-12162错误,第一反应是TNS,但第二反应告诉…

Oracle“ ORA-12162:TNS:net服务名称指定不正确”错误和解决方案

During the connection to the Oracle Database server with the sqlplus we may get an error with the ORA-12162 specifier. This error will prevent to connect to the Oracle Database Server. 在使用sqlplus连接到Oracle数据库服务器的过程中,ORA-12162说明符…

SDPT3 4.0版:半正定二次线性规划的MATLAB软件包

相关网址:http://www.math.nus.edu.sg/~mattohkc/SDPT3.html 或者点击“阅读原文”进入SDPT3网址

Matlab 凸优化工具包cvx安装更换版本步骤

/// 文章目录 cvx安装关于cvx更换版本错误的描述:关于cvx换mosek求解器: cvx安装 本部分为2019年9月刚接触cvx所写,比较浅薄,适合刚接触的人。 1、先去cvx官网下载cvx安装包。这里也有一份安装包,亲测可以使用 cvx安…

安装mosek并配置到matlab

1、之前一直使用sdpt3求解半定规划问题,写完模型后想跑大一点规模数据,当约束增加到14000+条的时候,调用sdpt3求解会出下下面报错: 在网上查半天发现都是提问类似问题没有解决,看了一下sdpt3的代码,sdpt3在求解前会检查约束是否是线性无关。个人理解线性无关或者线性相关…

在matlab中配置凸优化所需的求解器cvx、mosek之避雷

** 在matlab中配置凸优化所需的求解器cvx、mosek之避雷 ** 最近在看一些文章,其中有许多问题需要用到凸优化的求解,在用matlab求解一些凸优化的问题时需要用到求解包cvx。在安装mosek时遇到了一些问题,我想大部分的人应该也有遇到,所以写下来供大家参考。 cvx 的安装 (…

YOLOv8-pose之tensorrt版本

目录 一、环境安装 1、创建一个虚拟环境 2、下载TensorRT 3.TensorRT安装 4、其他库安装 二、模型转换及代码 (一)模型转换 导出ONNX模型 导出engine模型 (二)代码 完整的tensorrt推理代码: 三、遇到的问题…

Matlab+gurobi求解出现数值问题:numerical problems

本来以为matlabgurobi求解只会出现unfeasible的问题,没想到今天遇到了numerical problem?! 在使用matlabyalmipgurobi求解MILP问题时,可以求得解(解有数值,但解不满足约束)出现了报错“numerica…