_ init _（）函数 参数： self, config, pretrained_word_embedding, pretrained_entity_embedding, pretrained_context_embedding config： 设置的固定的参数！ pretrained_word_embedding： 根据下面的使用是…

空间插值是一类估计问题，其中已知值的位置用于估计其他位置的值，重点是利用空间局部性和趋势。传统的kriging方法具有很强的高斯假设，因此，往往无法捕获数据中的复杂性。kriging卷积网络（KCN），是一种结合图神经网络（GNN）和kriging优点的方法。与标准的gnn相比，kcn在进…

之前做了一个简单的网页，使用23andme格式snp2hla软件获得hla分型数据，当然准确性不咋的，也就玩玩，上线后为大约100人提供了服务，这是伯值得骄傲的事，因为第一次能为大家提供服务。代码我是放在了gitHub的&a…

HLA/RTI 分布式仿真初学者指南 【下载地址】HLARTI分布式仿真初学者指南 HLA/RTI 分布式仿真初学者指南 项目地址: https://gitcode.com/Open-source-documentation-tutorial/e17d6 资源介绍 本仓库提供了一个名为“HLA/RTI 分布式仿真初学者指南”的资源文件下载。该文…

我们在进行新抗原预测的时候，通常需要先进行HLA分型的预测。HLA基因分型对于理解个体的免疫反应特征、疾病易感性以及器官移植的匹配度具有重要意义。 主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex，MHC)是指染色体上一组决定移植组织是否相容…

高层体系结构HLA HLA（High Level Architecture）是构造分布仿真的高层体系框架。 组成部分： 规则(Rule) 对象模型样板OMT(Object Model Template) 运行支撑系统RTI(Run-Time Infrastructure)的接口规范说明(Interface Specification) 联邦…

HLA基因在免疫系统中扮演着重要角色，与人类的免疫反应密切相关。因此，准确预测HLA基因型对于疾病研究、器官移植、抗肿瘤免疫等领域具有重大意义。而seq2HLA正是一款常用的HLA基因型预测工具，它基于深度学习的方法，能够从RNA-Seq序…

关键词：HLA; typing; NGS; 本文整理搜集了用于HLA typing的软件，供大家参考。 原文地址：https://www.biostars.org/p/93245/ 先贴一张比较全的表格： 表格来源：https://www.nature.com/articles/jhg2015102/tables/2…

HLA按照面向对象的思想和方法来构建仿真系统，在面向对象分析与设计的基础上划分仿真成员，构建仿真联邦的技术。 联邦federation：用于达到某一特定仿真目的的分布仿真系统，由若干个相互作用的联邦成员构成。最典型的联邦成员是仿真…

名：高层体系结构（High Level Architecture，HLA） 高层体系结构（High Level Architecture，HLA）是从体系结构上建立这样一个框架，它能尽量涵盖M&S领域中所涉及的各种不同类型的仿真…

IPD-IMGT/HLA 项目使用教程 IMGTHLA Github for files currently published in the IPD-IMGT/HLA FTP Directory hosted at the European Bioinformatics Institute 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/im/IMGTHLA 1. 项目目录结构及介绍 IPD-IMGT/HLA 项目是一…

1.什么是HLA： HLA(human leukocyte antigen ，人类白细胞抗原)是人类的主要组织相容性复合体（MHC）的表达产物，该系统是所知人体最复杂的多态系统。自1958年发现(Jean Dausset)第一个HLA抗原，到20世纪70年代…

开源HLA仿真工具 【下载地址】开源HLA仿真工具 本仓库提供了一个最新的开源HLA（High Level Architecture）仿真工具。该工具使用C语言编写，包含了可编译的源代码以及详细的安装使用手册。无论你是仿真领域的初学者还是经验丰富的开发者&#x…

Optitype 软件安装 最开始尝试使用docker，无奈悲剧的失败，发现bioconda有这个软件的，于是上conda，感觉比docker更方便呢。还有一个好处是，win10家庭版不支持docker，要想支持得修改注册表一通操作&#xf…

RTI（Run-time Infrastructure） 概述 主要作用 具体实现了HLA接口规范。为了实现联邦内部各个联邦成员之间进行高效的信息交换，HLA接口规范用文字定义了各种标准服务和接口，而RTI则用程序设计语言将这些标准的服务和接口转成了标…

六大服务 联邦管理 主要内容 联邦管理是指对一个联邦执行的创建、动态控制、修改和删除等过程。 联邦执行是指在联邦（仿真系统）运行过程当中，RTI根据联邦成员的请求，用一个指定的FOM及相关的联邦细节数据，为实现联…

HLA对象模型模板 HLA采用对象模型（Object Model）来描述联邦及联邦成员。该对象模型描述了联邦在运行过程中需要交换的各种数据以及相关信息。 HLA规定必须用一种统一的表格——对象模型模板（OMT，Object Model Template&#xff…

HLA（high level architecture） 高层体系结构 简介 HLA 是分布交互仿真的高层体系结构，它不考虑如何由对象构建成员，而是在假设已有成员的情况下考虑如何构建联邦。HLA 主要考虑在联邦成员的基础上如何进行联邦集成，即…

HLA仿真程序设计基础 HLA仿真程序设计即是在联邦设计的基础上通过合理地使用RTI服务来达成仿真联邦的目的。 要理解基于HLA的仿真程序设计，首先必须理解联邦执行的生命周期，同时还要掌握联邦执行的整个生命周期中联邦执行的各种状态以及联邦成员、联邦…

HLA程序开发 使用pRTI所给starterkit 实例 这个燃油经济联邦用于评估不同制造商的汽车使用有限的燃油可以行驶多远，每个汽车制造商都提供一个仿真器来模拟选定的模型，上述就是联邦的示意图。 A品牌模拟他们的319和440d模型，B品牌模拟他们的…