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的安装流程)
FoldX(FoldX5)的安装流程
下载地址:官网
https://foldxsuite.crg.eu/]
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我将foldx_20241231改为foldx vim ~/.bashrc 将foldx文件所在路径写进PATH
vim ~/.bashrc我的…
根据数据集CSV文件中PDB ID批量下载结构文件
mmseq2结果经过格式转化后（mmseqs2蛋白质聚类数据格式转化-CSDN博客），再进行数据集的划分（python划分CSV格式的数据集-CSDN博客），数据格式为IDX，CLUSTER，HOMOLOG。 download_mmcif.p…
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三级结构_蛋白生信分析高级篇：三级结构及功能预测
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蛋白-小分子对接中受体结构的选取
在分子对接中，受体结构的选取至关重要，它直接影响到对接结果的准确性和可靠性。随着AlphaFold及结构解析技术（如X射线晶体学、核磁共振成像NMR、冷冻电镜Cryo-EM）的迅速发展，研究者们能够获得越来越多高分辨率的受体结…
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项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/py/pypdb
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背景简介
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python爬虫-爬取蛋白晶体、分子结构和序列
文章目录 前言一、环境准备二、爬取PDB蛋白结构1.下载指定数量的随机PDB2.下载指定靶标的PDB二、从ZINC爬取小分子mol2结构1.下载指定数量的随机分子2.下载指定分子三、从ChEMBL爬取小分子信息1.下载指定ID的SMILES（测试不成功，网站变成readonly了）四、从uniprot爬取fasta序…
AI4S - 高质量 RCSB PDB 蛋白质结构筛选与过滤 教程
欢迎关注我的CSDN：https://spike.blog.csdn.net/ 本文地址：https://spike.blog.csdn.net/article/details/132416164 免责声明：本文来源于个人知识与开源资料，仅用于学术交流，不包含任何商业技术，欢迎相互学习，不支持转载。 Protein Data Bank (PDB) 是一个收集和存储三…
pymol安装使用；vscode蛋白质可视化插件 protein viewer；rcsb pdb，fasta蛋白wget下载
pdb文件字段说明学习：
1、pymol安装使用
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1、可以直接conda安装，一条命令
conda install -c schrodinger pymol-bundle安装成功后输入pymol即可调出窗口2、 也可以…
用http协议在rcsb.org自动下载pdb文件
请参考rcsb官方提供文档接口 由于python提供接口简单,所以选择了它
程序流程
1.从thefile.txt 文件中读取蛋白序列
2.然后从rcsb 查询,获取查询XML数据
3.解析XML文件
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#!/usr/bin/python
# -*- coding: UTF-8 -*-…
渗透测试之Kali如何利用CVE-2019-0708漏洞渗透Win7
环境：
1.攻击者IP：192.168.1.10 系统: KALI2022（vmware 16.0）
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问题描述：
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c mysql安装教程 pdf_MySQL下载安装、配置与使用教程详细版（win7x64）
用过MySQL之后，不论容量的话，发现比其他两个(sql server 、oracle)好用的多，一下子就喜欢上了。下面给那些还不知道怎么弄的童鞋们写下具体的方法步骤。 我这个写得有点太详细了，甚至有些繁琐，有很多步骤在其他的教程文…
Ansys Zemax｜多边形扫描仪设计示例
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下面是使用混合模式设计多边形扫描仪的示例。 本文使用以下功能： 创建多边形物体 混合模式 多重结构 多边形扫描仪是使用多面镜的光学系统。
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但是，如果多面镜像旋转，并且您希望在下一…
Ansys Zemax | 如何模拟双折射偏振器件
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这篇文章介绍了什么是双折射现象、如何在OpticStudio中模拟双折射 (birefringence)、如何模拟双晶体的双折射偏振器以及如何计算偏振器的消光比。
什么是双折射现象
一般的光学材料都是均匀的各向同性的，也就是说无论光从哪个方向穿过材料，…