fMRI dpabi处理经验（一） dpabi用以处理fMRI、MRI数据非常好的matlab工具箱，下载地址：dpabi。下面来介绍下我在学习使用的过程中遇到的问题及操作吧。 fMRI处理常见问题 打开matlab后再命令窗口输入dpabi打开界面，fM…

以后研究自闭症谱系障碍（ASD），为此学习使用DPABI对fMRI数据进行分析，本篇博客记录DPABI的安装以及运行过程中遇到的问题。 严老师官方教程：The R-fMRI Course bilibili转载的过往教程：rs-fMRI原理与数据分…

DICOM转NIFTI是通常的需要，今天就熟悉DPABI完成数据转换，具体如下。 （1）整理好数据并启动 ①:设置路径为整理好数据的文件夹路径。 ②:设置处理模板为Blank 即空白模板（未选中默认参数）。 ③:选中&#…

新手发布，如果有错误或者补充，欢迎捉虫~ dpabi的双样本t检验计算 使用做过Quality Control之后生成的subjectlist对falff和reho进行筛选，得到进入分析的falff和reho文件（一般为sz开头，如果在falff之前做过smooth建议…

参考博客：https://blog.csdn.net/ScarlettGuo/article/details/107889578 目录 一.预处理： 二.脑区划分后计算灰质体积及特征提取 三、nc、sz组间差异可视化 另：对模板进行匹配切割 一.预处理： 二.脑区划分后计算灰质体积及…

| 图源 由于暂未发现MRI扫描对人体的伤害，加上MRI影像的超高空间分辨率，所以MRI脑影像分析理所当然的成为了脑科学研究最重要的手段之一。MRI脑影像主要包括两种，结构MRI脑影像（此后简称sMRI脑影像）和功能MRI脑影像&am…

新手发布，如果有错误或者补充，欢迎捉虫~ 打开dpabi，点击Utilities 选择Image Calculator 1、Groups： 我没有使用过这个部分，我猜测应该和Group mask的生成原理比较类似，选择一组nii文件，针对这…

新手发布，如果有错误或者补充，欢迎捉虫~ 目录 dpabi view的使用及多重比较矫正基本介绍：导入图像：多重比较矫正（基于Cluster）脑区显示结果汇报结果提值 dpabi view的使用及多重比较矫正 打开dpabi&#xf…

数据很乱不会重新整理 开始输入文件夹 开始 IMA：西门子的机器 dcm：有些也以dcm结尾 none: 没有后缀，要保证文件里没有任何别的带标志的，不然出错 输入文件夹 output：整理之后的结果 整理成两个格式

dpabi在 电脑里面装了好久了，要捡起来处理fMRI ，小白记录一下首次运行的过程和坑。 1、 基于matlab 安装好DPABI 工具箱 Dpabi的下载与安装 2、自官网下载数据 http://rfmri.org/content/demonstrational-data-resting-state-fmri 3、查看DemoData文件夹…

目标 在Ubuntu服务器的docker镜像中用MATLAB运行DPABI（以及使用DPARSF的功能）。 环境 系统： 在Ubuntu的docker镜像中（Ubuntu 18.04.6 LTS），远程可视化用的是VNC（xfce4）。 MATLAB版…

Tips：对fMRI功能图像和结构图像预处理的可参考另外一篇博主的文章，很详细。点击跳转 但是对于我所要分析研究的fMRI数据没有结构像，所以那篇文章对于我来说也是一个学习和参考，也是摸索了好久才有点头绪，希望自己的一点经验能帮到大家。 目录 一、准备工作二、勾选预处理项…

dpabi下载及安装 dpabi下载后，存储在任意位置，并将存储路径添加到matlab的path，例我的dpabi存储在"E:\matlab\soft\DPABI_V4.0_190305"，添加步骤如下： 运行dpabi 命令行输入dpabi，然后回车 一路确定 选择dpasf

最近打算做一些脑功能相关的分析，采用dpabi这个软件，记录一下遇到的错误 首先是安装，就采用先安装spm12，在安装dpabi 记得关闭VPN，不然一直无法弹出界面，会一直卡在这里

安装过程很简单，官网写的也很明白，会写这篇是因为不太熟悉很多软件，导致安装过程出现了很多小问题。 以前都是在matlab中运行dpabi，matlab安装起来很麻烦，而且安装包很大，我现在用的版本已经有20g&#xf…

整个静息态fMRI 影像处理，一个dpabi界面上参数好多呀，先初步理一遍，后面具体处理了再补充记录

1.预处理 这里预处理用Gretna软件进行，共分为以下几步： （1）DICOM转NIfTI格式 (2)去除前10个时间点(Remove first 10 times points)：由于机器刚启动、被试刚躺进去也还需适应环境，导致刚开始扫描的数据很…

DPABI是是中科院心理研究所严超赣老师团队开发的一款磁共振脑影像数据分析工具包。基于SPM，在安装DPABI之前需要安装好SPM，才能正常使用。SPM的安装方法见文matlab2021a版本条件下安装spm_kidllll的博客-CSDN博客 1、下载安装包 下载地址：D…

分析rs-fMRI数据之前进行预处理是第一步，直接上验证过的非常详细的DPABI预处理步骤如下。 1.理论知识——通用的fMRI数据预处理 (1) 去除开始的几个时间点 　　扫描仪启动后，需要初始化，初始化时的磁场是不稳定的，为了去除不稳定…

DPABI小鼠数据处理指南 【下载地址】DPABI小鼠数据处理指南 本仓库提供了一个名为“dpabi小鼠数据处理.pdf”的资源文件，该文件详细介绍了如何使用DPABI工具进行小鼠数据处理。DPABI（Data Processing & Analysis for Brain Imaging）是一款…