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2025/2/3 10:49:17
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mac端口被占用解决方法
通常情况下:lsof -i:#{port} 就可以找到对应的进程的pid kill -9 #{pid} 直接终结 kill -15 #{pid} 等待正在进行的任务完成再终结 本次纪要 问题出现: 当我想要使用docker启动mysql的时候报错:Error response from daemon: Ports are not…
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【Vue】路由器插件——vue-router
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16S基因全长1500bp左右,基因序列包括间隔分布的保守区和可变区,对于细菌一般包括10个保守区(C1-C10)和9个可变区(V1-V9)。不同种类的细菌有相同的保守区序列和不同的可变区序列,因此可以根据保守…
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16s rRNA微生物分析报告如何获得关键和有用分析
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16s扩增子 qiime2 实战
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NCBI数据库—上传16S rRNA测序数据
NCBI上传16S rRNA测序数据 1.登陆NCBI官网 NCBI官网链接 2.选择上传序列类型 上传16S rRNA测序数据,直接选16S rRNA就可以,然后弹出上传数据集的类型,选择SRA 3.注册NCBI账号 选择SRA后,会弹出如下的一些提示信息,直接选择submit即可; 3.1 进入提交信息页面 …
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古细菌多样性分析16S rRNA
古细菌(archaebacteria)又叫古生菌、古菌,是一类很特殊的细菌,同时具有原核生物和真核生物的某些特征。古细菌多生活在各种极端的生态环境中,它们代表了生命的极限,确定了生物圈的范围。古细菌和真细菌、真核生物一起,构成了生物的三域系统。古细菌分为泉古菌、广古菌、…
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细菌或原核生物16S rRNA
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微生物多样性数据分析(16S)
微生物多样性数据分析(16S) 9个可变区,10个保守区,扩增V3区、V4区、或者一起、或者V6、V9。 OTU(Operational taxonomic unit) OTU(operational taxonomic units) 是在系统发生学研究或群体遗传学研究中,为了便于进…
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16s扩增子分析注意事项和经验总结Tips
个人1年多16s/ITS扩增子分析中积累的点点滴滴,此文适合新人了解相关零散知识,也适合有分析经验的人交流与讨论。 以下分析的经验,是以测序数据类型为Illumina HiSeq 2500产出的双端250数据类型(PE250)为基础。 扩增测序技术选择:…
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16S测序
这篇文章主要写介绍16S测序的相关知识,之后如果我有时间会写16S的数据处理,设计生物信息学的内容。 文章目录 宏基因组学扩增子测序全基因组测序 微生物微生物鉴定形态学生理学噬菌体血清型核酸碱基组成分子杂交 16S测序S-沉降系数超速离心16SrDNA和16Sr…
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16s rDNA数据分析经验总结
原文来自fanyucai博文,有修改和删减。 去除嵌合体序列,推荐使用UCHIME多样性中,距离选择现在包括两种,一种是物种距离(Jaccard\Bray-Curtis);另一种是基于进化的距离(Unifrac),基于进化的距离还…
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